Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit3W8DXL4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit3W8DXL4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms