Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r10W4VSP8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms