Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpinb6cW4VSP4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms