Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3839S4R1W1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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