Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms