Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubl3Q9Z2M6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubl3Q9Z2M6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubl3Q9Z2M6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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