Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pdpk1Q9Z2A0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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