Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn6Q9Z262 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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