Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms