Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VarsQ9Z1Q9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms