Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5Q9Z131 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Sh3bp5Q9Z131 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Sh3bp5Q9Z131 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Sh3bp5Q9Z131 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms