Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl8Q9Z121 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl8Q9Z121 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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