Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NgfrQ9Z0W1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms