Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn9Q9Z0S7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn9Q9Z0S7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn9Q9Z0S7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cldn9Q9Z0S7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cldn9Q9Z0S7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn9Q9Z0S7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms