Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin2Q9WVE8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms