Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katna1Q9WV86 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Katna1Q9WV86 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms