Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VapaQ9WV55 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms