Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FarsbQ9WUA2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FarsbQ9WUA2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms