Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms