Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pfdn5Q9WU28 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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