Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms