Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PplQ9R269 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms