Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx6Q9R1R0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms