Protein–RNA interactions for Protein: Q9R190

Mta2, Metastasis-associated protein MTA2, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mta2Q9R190 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mta2Q9R190 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms