Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra1Q9R118 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms