Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod3Q9R0E1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms