Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc3Q9R0B6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc3Q9R0B6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms