Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BcamQ9R069 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms