Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms