Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtsjQ9R014 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms