Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms