Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Clcf1Q9QZM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcf1Q9QZM3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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