Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZK7

Dok3, Docking protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok3Q9QZK7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dok3Q9QZK7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok3Q9QZK7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dok3Q9QZK7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms