Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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