Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms