Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd4Q9QY39 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms