Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms