Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnip3Q9QXT8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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