Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms