Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Homer2Q9QWW1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms