Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-OaQ9QWV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-OaQ9QWV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms