Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl2Q9QUK0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms