Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoaQ9QUI0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhoaQ9QUI0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms