Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Thsd1Q9JM61 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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