Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Crlf1Q9JM58 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Crlf1Q9JM58 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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