Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms