Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gde1Q9JL56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms