Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hip1rQ9JKY5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hip1rQ9JKY5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms