Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms