Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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